体育与健康科学学院前身为体育系，始建于1975年，2009年更名为体育科学学院，2019年再次更名为体育与健康科学学院。1977年招收第一届本科生，2006年获批体育教育训练学（二级学科）硕士学位授予权，2007年开始招收硕士研究生，2017年获批体育学（一级学科）硕士学位授予权。学院设有体育教育和社会体育指导与管理2个本科专业，在校本科生815人；现有体育人文社会学、运动人体科学、体育教育训练学、民族传统体育学四个二级学科方向，学术型硕士研究生共137人。学院是黑龙江省最具影响力的体育学培养单位之一，先后被授予黑龙江省体育科学学会学校体育专业委员会主任单位，黑龙江省高校体育专业组主任单位，黑龙江省体育科学学会管理学分会主任单位，黑龙江省东南部高校体育研究会会长单位，牡丹江市体育学领军人才梯队单位。体育教育专业在黑龙江省名列前三位，是黑龙江省一流专业建设单位、校级重点专业，社会影响较为广泛。学院已为体育事业培养9000余名本科、专科、进修和函授学生。

学院传承了“大荒地”精神，自力更生、艰苦奋斗，师资队伍总体实力较强，教学科研管理机构设置较为合理、教学场馆设施配备较为齐全。现有5个教研室、1个教研部；设有运动解剖学、运动生物力学等7个实验室及大学生体育测试中心；建有篮排球馆1座、体操馆1个、乒乓球馆1个、艺体馆2个、健美健身馆1个、标准比赛游泳馆1座、国家二类田径场1个、室外网球场4个、室外篮球场26个、室外排球场12个等场馆设施；学院现有教职工59人，其中专任教师41人，含教授7人、副教授13人、讲师18人、助教3人，专任教师中具有博士学位4人、硕士学位36人，硕士生导师（含校外）共计27人。形成了年龄结构、职称结构、学历结构、学源结构等较为合理的师资队伍。近年来，获批国家社科青年项目、教育部教育规划课题、省教育厅一般项目、省哲学社会科学规划办扶持共建项目、省教育厅基本科研业务费项目、牡丹江社科联项目、各类横向课题等，立项总数80余项，经费300余万元。在《北京体育大学学报》《武汉体育学院学报》《东北师范大学学报》等期刊上，发表学术论文300余篇，出版专著、教材28部，获批国家发明专利19项，获各级各类科研奖励近100项，获省教学成果二等奖2项，校教学成果一等奖2项。在全国大学生田径锦标赛、全国高师田径运动会、中国龙舟公开赛、黑龙江省学生运动会等省级及以上学科竞赛中获奖1000余项。

学院贯穿“师范教育精英化，非师教育卓越化”的人才培养主线，不断开拓思路、更新观念，以就业为导向，重视学生技能的培养与提高，实施教学、训练、科研三位一体的人才培养模式改革，以课程体系、教材建设为主要内容，不断提高教学质量，努力将专业建设成为教育理念先进、培养模式领先、课程体系优化、学生素质全面的特色专业。全力打造“学生品牌”的理念，创建“温馨、自主、竞合、高效、团结”的团学组织，以培养学生做人、做事、做学问的本领为目标。现已成为省内体育学科优势明显、相关学科协调发展、竞技体育特色突出、创新能力一流的教学研究型学院，为区域经济建设与社会发展做出了积极的贡献。