体育与健康科学学院前身为体育系，始建于1975 年，1977年开始招收第一届本科生。2006 年获批体育教育训练学（二级学科）硕士学位授予权，2007 年开始招收硕士研究生。2017 年获批体育学（一级学科）硕士学位授予权，现有体育人文社会学、运动人体科学、体育教育训练学、民族传统体育学四个二级学科方向学术型硕士研究生共 137人；学院设有体育教育和社会体育指导与管理2 个本科专业，在校本科生815人。体育教育专业在黑龙江省名列前三位，是黑龙江省一流专业建设单位、校级重点专业，社会影响较为广泛，为体育教育事业培养了近9000名本科、专科、进修和函授学生。

学院是黑龙江省最具影响力的体育学培养单位之一，先后被授予黑龙江省体育科学学会学校体育专业委员会主任单位，黑龙江省高校体育专业组主任单位，黑龙江省东南部高校体育研究会会长单位，牡丹江市体育学领军人才梯队带头人单位。学院传承了“大荒地”精神，自力更生、艰苦奋斗，师资队伍总体实力较强，教学科研管理机构设置较为合理、教学场馆设施配备较为齐全，现有5个教研室、1 个教研部；设有运动解剖学、运动生物力学等 7 个实验室及大学生体育测试中心；建有篮排球馆1座、体操馆1个、乒乓球馆1个、艺体馆2个、健美健身馆1个、标准比赛游泳馆1座、国家二类田径场1个、室外网球场4个、室外篮球场26个、室外排球场12个等场馆设施； 配有专任教师42人，含教授7人、副教授14人、讲师18人、助教3人，其中，硕士35人、博士4人；硕士生导师共计25人。形成了年龄结构、职称结构、学历结构、学源结构较为合理的师资队伍。近年来，获批国家社科青年项目、教育部教育规划课题、省教育厅一般项目、省哲学社会科学规划办扶持共建项目、省教育厅基本科研业务费项目、牡丹江社科联项目、各类横向课题等，立项总数80余项，经费300余万元。在《北京体育大学学报》、《武汉体育学院学报》、《东北师范大学学报》等期刊上，发表论文300余篇；出版专著、教材25部；获批国家发明专利19项；获各级各类科研奖励近100项；获省教学成果二等奖2项，校教学成果一等奖2项。在全国大学生田径锦标赛、全国高师田径运动会、黑龙江省学生运动会等学科竞赛中获奖1000余项。